Если INVITE не доходит до АТС, то нет смысла в даунгрейт прошивки MikoPBX
Если INVITE не виден в sngrep, то он не доходит до MIkoPBX, вероятно "отсекается" на вышестоящем оборудовании.
Обратите внимание на настройку внешнего IP адреса для сетевого интерфейса. Если адрес указан, а телефон не относится к "локальной сети", то в сторону телефона АТС будет представляться внешним адресом, соответственно телефон будет слать ответы на внешку.